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14 thg 4, 2020 · RCTD是一种将单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释转移到空间转录组学数据的方法，通过整合两种数据，能精确为空间spots分配细胞类型，帮助理解空间组织结构中的基因表达情况。
RCTD learns cell type profiles from the scRNA-seq dataset, and uses these to label the spatial transcriptomics pixels as cell types. RCTD has been tested across a variety of spatial …
19 thg 11, 2022 · 稳健细胞类型分解 (Robust Cell Type Decomposition，简称RCTD)是一种从空间转录组数据中学习细胞类型的统计方法。 在本次示例中，我们将为小脑Slide-seq数据集反卷积注释细胞 …
19 thg 8, 2021 · 使用spacexr库进行Visium空间转录组数据全模式分析，通过RCTD方法实现单细胞注释与区域差异表达研究，涵盖数据预处理、反卷积权重计算及可视化步骤。
2 thg 11, 2021 · 为了评估 RCTD 在存在平台效应的情况下检测和分解空间转录组学数据中的混合物的能力，我们在 snRNA-seq 小脑参考上训练了 RCTD，并在模拟为单细胞与已知细胞类型的计算混合物 …
11 thg 3, 2025 · Robust Cell Type Decomposition (RCTD) is a statistical method for decomposing cell type mixtures in spatial transcriptomics data. In this vignette, we will use a simulated dataset …
20 thg 10, 2024 · RCTD 通过整合单细胞和空间转录组学数据，能够较为精确地为空间点（spots）分配细胞类型或细胞类型的混合，以便更好地理解空间组织结构中的基因表达情况。
Welcome to RCTD, an R package for learning cell types and cell type-specific differential expression in spatial transcriptomics data. RCTD inputs a spatial transcriptomics dataset, which consists of a …
18 thg 2, 2021 · Spatial mapping of cell types with RCTD enables the spatial components of cellular identity to be defined, uncovering new principles of cellular organization in biological tissue.
方法简述 Robust cell type decomposition（RCTD）去卷积分析需要用到注释好的scRNA-seq数据，如果 空间转录组 （ST）与单细胞转录组（scRNA）样本包含类似的细胞类型种类，每个Spot可能包含 …
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